Groupe gestion des données de la recherche

Animation du groupe

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Mis à jour en juillet 2023
Nous contacter : mailto: groupe-donnees-lped@listes.ird.fr
Pour les timides, n'hésitez pas à nous contacter individuellement. On fait remonter les demandes au niveau du groupe deux fois par mois.

Nos activités et actualités

1. Le groupe de gestion de données de recherche du LPED

Qui sommes-nous ?

Artadji, Clémentine, Estelle, Fabienne, Laura, Laurence, Marc, Valérie D, Yoan

Que faisons nous ?

Le Groupe Gestion des Données se donne pour objectif de réfléchir à la place des données dans les programmes de recherche, d’identifier les besoins en matières de collecte, de traitement et d’archivage des données. Nous souhaitons accompagner les chercheurs vers la science ouverte selon la stratégie suivante :

Identifier les besoins du laboratoire
S’appuyer sur des infrastructures de données / serveur déjà existantes
Se former sur l’évolution des règlementations
Veiller sur les outils informatiques
Proposer des formations

Ce groupe a également pour vocation de mener les réflexions sur le droit et l’éthique dans la gestion des données de la recherche.

Heu, plus concrètement ?

On vous accompagne / conseille sur les plans de gestion de données, les questions de RGPD et d'éthique, la mise en place de la collecte de données (design de l'étude, choix des outils de collecte, formation aux outils), l'analyse de données (choix des méthodes, choix des outils - ex : R ou QGis, formation aux outils), le stockage et la sécurisation des données, l'ouverture des données (choix d'un entrepôt, choix du standard de métadonnées), l'ouverture des publications (HAL).

On fournit du matériel.

Nous avons à ce jour 4 tablettes Android et 2 tablettes Windows réservables sur le grrr (https://grr.osupytheas.fr) puis à venir retirer dans le bureau d'Artadji et Laura.
Nous avons également 6 Raspberry PI4 et 2 Raspberry Pi400 (pas de réservation sur grrr, venir directement dans le bureau de Laura et Artadji)

Concernant le logiciel de collecte de données KoboToolBox, nous assurons des formations très régulières à la demande. C'est également nous qui créons vos comptes sur l’instance de l'OSU (conforme RGPD).

On propose également des formations à l'ensemble du labo, soit parce que nous avons identifié un besoin, soit parce qu'on nous l'a demandé.

Qu'est-ce qu'on ne fait pas ?

On ne fait pas d'assistance informatique, on ne fait pas à votre place, on ne fait pas les contenus des wikis (sites Internet). Par exemple, on vous accompagne sur la rédaction du plan de gestion de données, mais on ne remplit pas les rubriques à votre place. On vous forme à KoboToolBox et on répond à vos questions, mais on ne s'occupe pas de faire votre questionnaire.

Qui peut nous solliciter et comment ?

Tous les membres du laboratoire peuvent nous solliciter, quelque soit votre statut, pour vos projets de recherche. Nous pouvons également participer aux réflexions au sein des axes scientifiques sur des besoins plus transversaux ou des programmes de recherche. Plus vous nous sollicitez en amont du début des projet, plus vous augmentez vos chances d'avoir une réponse adaptée et de la disponibilité. Si nous n'avons pas les compétences ou le temps nécessaire en interne, nous vous redirigerons vers d'autres personnes ressources de nos tutelles.

Pour nous solliciter, le plus simple est de nous écrire à l'adresse suivante : groupe-donnees-lped@listes.ird.fr

Ce groupe a l'air génial, comment nous rejoindre ?

Le groupe est ouvert à tous les membres du laboratoire, ingénieur.e, chercheur.e, CDD, doctorant.e.s, stagiaire. Vous pouvez vous joindre à nous de manière ponctuelle sur des projets qui vous stimulent ou de manière plus régulière. Vous serez alors ajouté.e à notre liste de diffusion. Les réunions sont ouvertes à toustes. Pour connaitre la date de la prochaine réunion, vous pouvez consulter le Chaski ou nous faire un mail.

2. Actualités sur les données de la recherche

Au LPED

👉🏼Retour et suite de la journée RGPD

Les notes et les diapos de la journée RGPD du 9 janvier ont été mises en ligne sur le Chaski. Vous pouvez les retrouver sur la page RGPD (Menu / Appui Recherche / Données / RGPD et Nagoya) : https://lped.info/?NagoYa OU sur la page dédiée à la formation (Menu / Formation / Formations et ateliers 2024 / RGPD) https://lped.info/?RGPD9janv

Suite à cette journée, les réflexions se poursuivent sur RGPD et IA. Si vous souhaitez rejoindre le groupe de travail faites nous signe.

👉🏼Les ateliers QGis

Une fois par mois, Artadji vous propose un atelier QGis (logiciel de traitement de données SIG) sur une compétence spécifique. Surveillez le Chaski pour ne rien rater ! Si vous avez des besoins particuliers, n'hésitez pas à les faire remonter.

👉🏼Nouvelles tablettes

Nous avons remplacé 2 tablettes Android devenues défectueuses (Wombat et Diplodocus) par 2 nouvelles tablettes Android Samsung Tab A9+ (Tintin et Milou). Depuis peu nous avons également 2 tablettes Windows. Pour réserver une tablette, aller sur le grr (https://grr.osupytheas.fr/day.php?year=2024&month=6&day=6&area=134 connexion avec un compte OSU) puis venez les récupérer dans le bureau d'Artadji et Laura.

👉🏼Réflexions sur des ordinateurs plus puissants

Nous menons actuellement une double réflexion sur des besoins en équipements et formations futures :

s'équiper en poste de calcul plus puissant pour la géomatique,
se former à l'utilisation de cluster de calcul mis à disposition par le service informatique de l'OSU

👉🏼Pistes de projets à venir

Plusieurs projets pour le laboratoire sont en cours de réflexion :

une journée sur l'amélioration des pratiques sur la collecte de données de terrain avec mise en situation
data rescue : organisation d'atelier pour démystifier l'ouverture des données

A l'IRD

👉🏼Geoportail

L'IRD a déployé un nouveau portail sur le même modèle que DataSuds. Il s'agit d'un nouvel entrepôt dédié aux données géographiques, DataSuds-geo, qui permet aux irdiens et leurs partenaires de déposer leurs données géoréférencées.

👉🏼COP

La mission science ouverte de l’IRD a lancé les communautés du numérique scientifique, qui rassemblent les spécialistes du numérique scientifique en un lieu de de partage, d’entraide et de collaboration ouvert à tous. Ce réseau a vocation à être un lieu d’échange, de collaboration, de mutualisation de connaissances et de production collaborative. Il est ouvert à tout agent IRD ou partenaire de l’Institut qui produit gère ou utilise des outils numériques scientifiques, y compris les doctorants et doctorantes.

Pour l’heure, le réseau propose un forum de discussion commun, ainsi qu’un wiki collaboratif pour chacune des deux premières communautés :

La communauté de développement logiciel collaboratif
La communauté de gestion des données de recherche en santé

Contact : hugo.catherine@ird.fr

A l'AMU

👉🏼Le guichet de la donnée

Lancement d’un nouveau service dédié à la gestion et à l’ouverture des données de Recherche : le Guichet de la Donnée du site d’Aix-Marseille (GDsAM).

Le GDsAM répond à tous besoins d’informations, de conseils, de formations, d’accompagnements juridique ou opérationnel, et même de soutiens directs aux projets de recherche de vos laboratoires. Le guichet vous accompagne également, pour tout ce qui concerne la gestion des données de Recherche en vue de leur FAIRisation pour faciliter une future réutilisation.
Ce guichet permet de mettre en contact des experts du cycle de vie de la donnée de Recherche quels que soient la discipline et le statut du demandeur (chercheur, enseignant-chercheur, ingénieur, étudiant) qui en éprouve le besoin dans le cadre d’un projet, qu’il soit disciplinaire ou interdisciplinaire.
GDsAM permet de créer le dialogue entre experts et demandeurs à travers une adresse unique : www.guichet-donnee.univ-amu.fr
Dans la foulée, AMU a décidé d’ouvrir un espace institutionnel sur l’entrepôt-catalogue national dédié aux données de la recherche DAT’AMU,: https://entrepot.recherche.data.gouv.fr/dataverse/univ-amu

A l'OSU

👉🏼Des nouveaux outils !

Rappel : portail des outils informatique de l'OSU : https://portail.osupytheas.fr/
HedgeDoc : Edition collaborative en Markdown. C'est comme un pad avec plus d'options de mise en page qui permettent un rendu un HTML beaucoup plus satisfaisant ! Exemple 1 : https://hedgedoc.osupytheas.fr/SmeWNb9wQqGyrOovu8ZekQ#; Exemple 2 : https://hedgedoc.osupytheas.fr/SfBBrru_SFy4VdPOMe8R9A?view#
Mattermost : messagerie interne, alternative libre à Slack ou Microsoft Teams

En savoir plus

Notre naissance : Presentation GGDR AG 2019 Notre premier anniversaire : Presentation Seminaire Dataverse 2020

Le Groupe Gestion des Données se donne pour objectif de réfléchir à la place des données dans les programmes de recherche, d’identifier les besoins en matières de collecte, de traitement et d’archivage des données.

Nous souhaitons accompagner les chercheurs vers la science ouverte selon la stratégie suivante :

Identifier les besoins du laboratoire
S’appuyer sur des infrastructures de données / serveur déjà existantes
Se former sur l’évolution des règlements
Veiller sur les outils informatiques
Proposer des formations

Pour accompagner les chercheurs, nous souhaitons évoluer collectivement pour être en mesure de proposer les outils qui répondent aux besoins en collecte de données (outil de collecte de données informatisé, carnet de terrain électronique, contrôle qualité, structuration, stockage), traitement (analyses statistiques, SIG), archivage et diffusion (documentation et métadonnées, entrepôts).

Ce groupe a également pour vocation de mener les réflexions sur le droit et l’éthique dans la gestion des données de la recherche.